新疆自治區(qū)中醫(yī)院是一所集醫(yī)療、教學、科研、預防保健為一體的綜合性中醫(yī)醫(yī)療機構(gòu)。1956年4月，經(jīng)自治區(qū)衛(wèi)生廳批準，在新疆公費醫(yī)療門診部的基礎(chǔ)上成立了自治區(qū)中醫(yī)門診部；1959年7月1日正式掛牌成立新疆維吾爾自治區(qū)中醫(yī)醫(yī)院；1986年4 月在保留新疆維吾爾自治區(qū)中醫(yī)醫(yī)院名稱的同時，又掛牌成為新疆中醫(yī)學院附屬醫(yī)院；1998年9 月新疆醫(yī)科大學成立以后，更名為新疆醫(yī)科大學附屬中醫(yī)醫(yī)院。2001年11月，醫(yī)院與中醫(yī)研究所順利合并，經(jīng)自治區(qū)編委批準掛有五塊牌子，即：新疆維吾爾自治區(qū)中醫(yī)醫(yī)院、新疆維吾爾自治區(qū)中醫(yī)藥研究院、新疆醫(yī)科大學附屬中醫(yī)醫(yī)院、新疆醫(yī)科大學第四臨床醫(yī)學院和新疆中醫(yī)名醫(yī)名方研究開發(fā)中心。醫(yī)院現(xiàn)有在職職工938人（不包括合同工、臨時工），行政管理人員29人，工人97人（含商業(yè)聯(lián)辦劃轉(zhuǎn)職工），專業(yè)技術(shù)人員812人，其中正高職稱專業(yè)技術(shù)人員48人，副高職稱專業(yè)技術(shù)人員115人，中級職稱專業(yè)技術(shù)人員304人。醫(yī)院現(xiàn)設(shè)有一個分院（開發(fā)區(qū)醫(yī)院）、三個門診部（黃河路門診部、大十字門診部、幸福路門診部）和一個戒毒康復中心。